O Botafogo de Futebol e Regatas possui sete sedes espalhadas pelo Rio de Janeiro e Niterói, onde nelas estão divididas as atividades do clube. Sendo elas: sede administrativa, esportes, jogos e eventos.
Construída em 1912, a sede de General Severiano é a mais antiga do clube, que teve seu primeiro jogo oficial na primeira partida do campeonato carioca de 1913, onde o Botafogo venceu o Flamengo por 1 a 0.
A partir de 2004, a sede de General Severiano passou a abrigar com todo conforto e infraestrutura a equipe profissional do Botafogo. A estrutura possui um campo de grama natural, um campo de grama sintética, um moderno e amplo vestiário com escaninhos personalizados, sala de lazer com TV e jogos e refeitório exclusivo para os atletas.
O Mourisco Mar é a sede de esportes aquáticos do Botafogo, situada entre cartões postais da Cidade do Rio de Janeiro. O local conta com uma piscina olímpica, na qual treinam as vitoriosas equipes de natação e polo aquático do clube, esta última apontada como a melhor do Brasil em 2009.
Inaugurado em 1969, o Complexo Esportivo Mourisco Mar é um dos mais tradicionais do Brasil na prática dos esportes aquáticos. Realizou inúmeras competições de natação, polo aquático e nado sincronizado, nos quais o Botafogo foi campeão Estadual e Brasileiro em diversas ocasiões. Faz parte da história do complexo a revelação de grandes talentos, que até hoje integram a Seleção Brasileira nos campeonatos internacionais.
O Sacopã, sede náutica do Botafogo fica na Lagoa Rodrigo de Freitas, ponto turístico da cidade, na Av. Epitácio Pessoa, 1.561. No local treina a equipe de remo do Botafogo e funciona a escolinha do clube.
A estrutura possui sala de massagem e fisioterapia, sala para a comissão técnica, salão de ginástica com academia e aparelhos de musculação, garagem para 50 barcos de competição, tanque de treinamento para até oito remadores, vestiários masculino e feminino, carpintaria para manutenção dos barcos.